En 2005, Des guerres, recueil de lettres envoyées à ses proches durant ses reportages au Nicaragua, au Kosovo, en Colombie, en Serbie, en Afghanistan, en Irak, a reçu deux prix prestigieux.
Dans Stumme Gewalt (Violence silencieuse), Carolin Emcke revient sur la Fraction armée rouge (Rote Armee Fraktion), ce groupuscule d'extrême gauche qui s'est rendu célèbre par une série de prises d'otages et de meurtres dans les années 70 et 80. Emcke a été personnellement concernée. Le 30 novembre 1989, le patron de la Deutsche Bank, Alfred Herhausen, était tué par la RAF. Il était le parrain de Caroline, alors âgée de 22 ans. Dans ce livre très personnel, elle affirme que les années RAF restent entourées d'un silence assourdissant, que l'Allemagne devrait briser par la parole. Stumme Gewalt a reçu le prix Theodor-Wolff, équivalent du prix Albert-Londres en France.
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